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1710-RNA指纹图谱:单细胞转录响应映射统计框架

RNA指纹分析是一种通过单细胞转录组测序将细胞对基因、药物或免疫刺激的反应映射到参考扰动字典上的统计框架。该方法首先通过多条件潜变量模型估计去噪后的扰动特征,随后利用受全基因组关联分析启发的贝叶斯回归技术,将未知查询细胞或基因组筛查结果映射到对应的可信集中。这一技术能够有效克服单细胞数据中的噪声与异质性,并成功应用于解析组合扰动、识别p53的上下文特异性调节因子、揭示药物的脱靶效应以及分析体内免疫细胞反应。通过将细胞状态与其潜在的诱发因素相连,该框架为单细胞数据集的因果推断和机制解析提供了强大的通用工具。

References:

Grabski I N, Lee J, Blair J D, et al. Mapping transcriptional responses to cellular perturbations with RNA fingerprinting[J]. Cell, 2026.

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